Plateforme phénotypage cellulaire et tissulaire
La Plateforme Phénotypage Cellulaire et Tissulaire met à disposition, pour l'ensemble de la communauté scientifique, une instrumentation de haute technologie.
Présentation
Celle-ci regroupe la cytométrie de flux, le tri cellulaire, le screening protéique et la préparation d'échantillons pour l'analyse ou le tri en cytométrie, pour le séquençage d'ARNm (RNAseq de tissu entier, cellules isolées …) ou le séquençage de cellules isolées (single cell RNAseq).
Expertises
La plateforme de Phénotypage cellulaire et tissulaire de l’Institut de la Vision est spécialisée dans les champs d’expertises suivants :
- Viabilité cellulaire
- Apoptose
- Activité des caspases
- Potentiel de membrane mitochondrial
- Prolifération cellulaire
- Cycle cellulaire
- Cytokines
- Quantification antigénique
- Immunomarquages directs et indirects, membranaires ou intracytoplamiques
- Caractérisation cellulaire et phénotypage
- Analyse bio-informatique des données de séquençage
Équipements
- Cytomètre analyseur Celesta SORP – Becton Dickinson – 4 lasers – 18 couleurs.
Le Celesta SORP est équipé du système HTS (Hight Throughput Sampler) qui permet une acquisition d'échantillons à haut débit entièrement automatisée.
Caractéristiques Laser :
LASER | Filtres | Miroirs | Fluorochromes |
|---|---|---|---|
Violet (405 nm) | 450/40 | N/A | BV421 |
525/50 | 505LP | BV510, BV480 | |
610/20 | 595LP | BV605 | |
670/30 | 655LP | BV650 | |
710/50 | 690LP | BV711 | |
780/60 | 750LP | BV786 | |
Bleu (488 nm) | 530/30 | 505LP | BB515, FITC |
610/20 | 595LP | BB630, PI | |
710/50 | 690LP | BB700, PerCP-Cy5.5 | |
Vert-Jaune (561 nm) | 586/15 | N/A | BYG584, PE, TdTomato |
610/20 | 600LP | PE-CF594 | |
670/30 | 635LP | PE-Cy5, 7AAD | |
780/60 | 750LP | PE-Cy7 | |
Rouge (637 nm) | 670/30 | N/A | APC |
730/45 | 690LP | APC-R700 | |
780/60 | 750LP | APC-H7, APC-Cy7 |
Cytomètre trieur Melody - Becton Dickinson - 3 lasers - 10 couleurs :
• Système de tri = 4 voies de tri Buse : 100 µm
• Formats de sortie de tri compatibles : Tubes 1.5, 2.0 et 5.0 mL
• Plaques de 6, 24, 48, 96 et 384 puits (Tri 1 voie)
• Plaques PCR de 96 puits- Lames microscope 3 x 9
Caractéristiques Laser :
LASER | Filtres | Miroirs | Fluorochromes |
|---|---|---|---|
Violet (405 nm) | 448/45 | N/A | BV421, DAPI |
528/45 | 500LP | BV510, CFP, AmCyan | |
Bleu (488 nm) | 488/15 | N/A | SSC |
527/32 | 507LP | FITC, GFP, BB515, AF488 | |
700/54 | 665LP | BB700, PerCP-Cy5.5, PerCP | |
Vert-Jaune (561 nm) | 582/15 | 582LP | PE, DsRed |
613/18 | 605LP | PE-CF594, mCHERRY | |
697/58 | 665LP | PE-Cy5, PE-Cy.55 | |
783/56 | 752LP | PE-Cy7 |
- Chromium 10x Genomics. Cet appareil permet l’isolement de cellules dissociées dans une gouttelette (jusqu’à 10000 cellules par échantillon) et de préparer des librairies 3’ à partir des ARNm contenus dans chaque gouttelette. Le séquençage de ces librairies permet d’étudier l'expression génique unicellulaire (transcriptome 3') et ainsi de profiler finement les dizaines de milliers de cellules contenues dans l’échantillon.