La plateforme met à la disposition des équipes de l’Institut des outils performants, une expertise, une assistance technique et une veille technologique dans l’objectif d’épauler les projets de recherche développés à l’Institut par une technologie de pointe.
La plateforme a pour vocation de satisfaire vos demandes en cytométrie et analyses liées aux activités de recherche des laboratoires, et d’être ouverte à l’ensemble de la communauté scientifique académique (CNRS, INSERM, SU...) et industrielle.
La plateforme propose différents services :
•la mise à disposition d’outils de hautes technicités
•la formation des utilisateurs
•les collaborations pour des projets de recherche et développement
•les prestations de service
Le personnel met tout en œuvre pour assurer le bon fonctionnement de la plateforme :
• organisation de l'activité (planning de réservation, stockage des données),
• formation / assistance des utilisateurs,
• suivi des projets et des analyses,
• maintenance et gestion du matériel et des équipements.
À ces équipements sont associées des activités de service et de développement technologique. La plateforme a, en effet un rôle de formation, de collecte et de transmission des connaissances.
Toutes ces activités sont réalisées dans le cadre de prestations de service ou de mise à disposition d’outils.
Équipements
Celesta SORP Becton Dickinson - cytomètre analyseur
La cytométrie en flux est une technique qui permet l’analyse à grande vitesse, sur une suspension de particules (cellules, bactéries, parasites, billes...), des caractéristiques individuelles de chacune d’elles telles que la taille, la forme et la complexité et de n’importe quel composant ou fonction qui puisse être détecté par un composé fluorescent.
Configuration Celesta SORP
| LASER | PUISSANCE LASER | DETECTEURS | FILTRES | MIROIRS | EXEMPLES |
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488nm FSC & SSC |
100 mW |
A B C |
780/60 695/40 530/30 |
750LP 670LP 505LP |
PerCP-Cy7 PerCP-Cy5.5 FITC, BB515 |
| 637nm | 100 mW |
A B C |
780/60 730/45 670/30 |
750LP 690LP |
APC-Cy7 APC-R700 APC |
| 405nm | 100 mW |
A B C D E F |
780/60 710/50 670/30 610/20 525/50 450/50 |
750LP 690LP 655LP 595LP 505LP |
BV786 BV711 BV650 BV605 BV510 BV421 |
| 561nm | 100 mW |
A B C D |
780/60 670/30 610/20 586/15 |
750LP 635LP 595LP |
PE-Cy7 PE-Cy5 PE-CF594 PE |
Exemples d'applications
• • Viabilité cellulaire: 7AAD ou Iodure de Propidium (IP)
• • Apoptose: annexine V-7AAD ou IP, pic subG1
• • Activité des caspases
• • Potentiel de membrane mitochondrial (JC-1)
• • Proliferation cellulaire (CFSE, BrDU)
• • Cycle cellulaire
• • Cytokines
• • Quantification antigénique
• • Immunomarquages directs et indirects, membranaires ou intracytoplamiques
• • Caractérisation cellulaire et phénotypage...
Melody Becton Dickinson - cytomètre trieur
Le trieur de cellules Melody est placé sous PSMII
Configuration Melody
| LASER | FILTRES | MIROIRS | EXEMPLES |
|
488nm FSC & SSC |
488/15 527/32 700/54 |
507LP 665LP |
SSC FITC, GFP, BB515, Alexa Fluor488 PerCP, PerCP-Cy5.5, 7-AAD |
| 405nm |
528/45 |
448/45 500LP |
DAPI, Proliferation Dye 450, BV421 BD Horizon V500, BV510, AmCyan, CFP |
| 561nm |
582/15 613/18 697/58 783/56 |
582LP 605LP 665LP 752LP |
PE, DsRed mCherry, BD Horizon PE-CF594, PE-Texas Red, PI PE-Cy5, PE-Cy5.5 PE-Cy7 |
10X GENOMICS
La plateforme est équipée du Chromium de la société 10x Genomics qui permet l’isolement de cellules dissociées dans une gouttelette (jusqu’à 10000 cellules par échantillon) et de préparer des librairies 3’ à partir des ARNm contenus dans chaque gouttelette. Le séquençage de ces librairies permet d’étudier l'expression génique unicellulaire (transcriptome 3') et ainsi de profiler finement les dizaines de milliers de cellules contenues dans l’échantillon.
Équipe
Responsable scientifique section cellulaire
Email: cecile.delarasse@inserm.fr
Luisa Riancho
Responsable opérationnelle
Email: luisa.riancho@inserm.fr
Xavier Guillonneau
Responsable scientifique section moléculaire
Email: xavier.guillonneau@inserm.fr
Frédéric Blond
Ingénieur bio-informatique
Email: frederic.blond@inserm.fr
Sebastien Augustin
Ingénieur biologie moléculaire
Email: sebastien.augustin@inserm.fr
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